Synonym: Polygala saxatilis Desf.
Polygala rupestris, qui présente un grand polymorphisme, est considéré comme un agrégat. Si les subsp. rupestris, oxycocoides et fontqueri sont les taxons les mieux tranchés, tous les intermédiaires existent entre les subsp. (Dobignard, 2009). Nous préférons nous en tenir à l'espèce s.l.